حجت الاسلام والمسلمین علامه سید جعفر خاتمي از محققان برجسته وصاحبنظر جهان تشیع بود که درمیان اهالی حوزه به  بینش سیاسی عمیق واستراتژیک شناخته میشد.

تحلیلهای عمیق وی از اوضاع ایران بویژه در سالهای آغازین انقلاب از نقش استعمار پیر در شکل گیری آن وتحلیل وی از حکومتهای شکل یافته بعد از توافقنامه سایس پیکو، وی را به یکی از سرسخت ترین منتقدان حکومتهای انقلابی در منطقه بدل ساخته بود.

دیدگاه سیاسی ژرف وی درکنار وی درشمار نخستین روحانیونی بود که به صف منتقدان رژیم ولایت مطلقه فقیه  وآیت الله خمینی پیوست.

پس از ماجراهای مربوط به جریان اشغال سفارت ایالات متحده آمریکا در سال 1979 وقطع روابط میان ایران وآمریکا وانزوای روزافزون ایران، وی با تهیه طرحی کامل، جامع وراهبردی درپی میانجیگری وحل اختلاف برآمد، اما نهادهای اطلاعاتی وامنیتی با متهم ساختن وی به ارتباط با کشورهای بیگانه او را بمدت سه ماه زندانی وتحت شکنجه های شدید روحی وجسمی قرار دادند.

روحیه نشاط وتحرک وپویایی کم نظیر این اندیشمند برجسته او را لحظه ای از تبلیغ فکر واندیشه اهل بیت صلوات الله علیهم اجمعین آرام نمی گذاشت. سفرهای تبلیغی او به دور افتاده ترین نقاط جهان از جمله كشورهاي افريقايي، درکنار مناسبات وروابط نزدیک وی با اندیشمندان ومتفکران کشورهای مختلف افق دید او را بسیار گسترده ساخته بود.

تلاش های خستگی ناپذیر وی برای تصحیح روند ویرانگری که از بدو ورود آیت الله خمینی به ایران وتاسیس رژیم جمهوری به اصطلاح اسلامی آغاز شده بود، وی را درمعرض آزارها وتهدیدها وشکنجه های فراوانی قرار داد که گاه تا مرز محکومیت وی به اعدام هم پیش رفت.

سفرهای مکرر وی به خارج از ایران برای تبلیغ بهانه دیگری شد تا حجت الاسلام والمسلمین علامه سید جعفر خاتمی دومین بار در سال 1363 خورشیدی به مدت چهار ماه به زندانهای مخوف آیت الله خمینی گرفتار شده واین بار بسیار شدیدتر تحت شکنجه های روحی وجسمی قرار بگیرد. پس از همین شکنجه ها بود که ایشان به بیماری سخت عصبی گرفتار آمد وپس از سالها دست وپنجه نرم کردن با بیماری های عدیده روحی وجسمی از جمله افسردگی تاجايي كه روزانه ٢٤ قرص مصرف ميكرد، سرانجام درسن 56 سالگی در درشامگاه  شنبه دهم آگوست 2013، سوم شوال 1434 به درجه رفیع شهادت نائل آمد وبه دیدار معبود شتافت.

با اجداد طاهرینش محشور باد، ان شاء الله